導致機組和泵房建筑物產生振動的原因較多，有些因素之間既有聯系又相互作用，概括起來主要有以下四個方面的原因。
電氣方面
電機是機組的主要設備，電機內部磁力不平衡和其它電氣系統的失調，常引起振動和噪音。如異步電動機在運行中，由定轉子齒諧波磁通相互作用而產生的定轉子間徑向交變磁拉力，或大型同步電機在運行中，定轉子磁力中心不一致或各個方向上氣隙差超過允許偏差值等，都可能引起電機周期性振動并發出噪音。
機械方面
電機和水泵轉動部件質量不平衡、粗制濫造、安裝質量不良、機組軸線不對稱、擺度超過允許值，零部件的機械強度和剛度較差、軸承和密封部件磨損破壞，以及水泵臨界轉速出現與機組固有頻率一直引起的共振等，都會產生強烈的振動和噪音。
水力方面
水泵進口流速和壓力分布不均勻，泵進出口工作液體的壓力脈動、液體繞流、偏流和脫流，非定額工況以及各種原因引起的水泵汽蝕等，都是常見的引起泵機組振動的原因。水泵啟動和停機、閥門啟閉、工況改變以及事故緊急停機等動態過渡過程造成的輸水管道內壓力急劇變化和水錘作用等，也常常導致泵房和機組產生振動。
水工及其它方面
機組進水流道設計不合理或與機組不配套、水泵淹沒深度不當，以及機組啟動和停機順序不合理等，都會使進水條件惡化，產生漩渦，誘發汽蝕或加重機組及泵房振動。采用破壞虹吸真空斷流的機組在啟動時，若駝峰段空氣挾帶困難，形成虹吸時間過長；拍門斷流的機組拍門設計不合理，時開時閉，不斷撞擊拍門座；支撐水泵和電機的基礎發生不均勻沉陷或基礎的剛性較差等原因，也都會導致機組發生振動。